垂直式超凈工作臺多用于實驗室，生物制藥，光電產業。水平式多用于電子，儀器儀表，組培行業。

水平式超凈工作臺是風從后部向前吹出，若臺面要放顯微鏡等小型儀器用培養皿培養或接種行業使用水平式，因如用垂直的話氣流會被儀器阻擋，一般檢驗用的多半會使用水平式，但使用水平式要注意對酒精燈火焰的影響。

潔凈工作臺箱體采用全鋼板制作、外表面靜電噴塑，有防生銹和防消毒腐蝕的能力。

潔凈工作臺的主要功能，是提供無塵無菌的局部潔凈環境。

超凈工作臺風機是潔凈工作臺的核心部件，一般采用可調風量的風機系統，通過調節風機的運行工況，可使潔凈工作區中的平均風速保持在規定范圍內，以滿足無菌操作的需求。

超凈工作臺沉降菌濃度：沉降菌濃度測試應在其他項目測試合格后進行，被測潔凈工作臺正常運行10min，沉降菌濃度測量邊界距離內表面或工作窗100mm。將裝有營養瓊脂φ90培養皿置于工作臺操作面上，根據要求布點，并暴露0.5h后，蓋上皿蓋，取出培養皿，在30℃~35℃的環境中培養48h。用肉眼計數培養皿中可見菌落數，計算平均值，要求不超過0.5cfu/(皿.0.5h)。

超凈工作臺是一臺較精密的電氣設備，首先要保持室內的干燥和清潔，潮濕的空氣既會使制造材料銹蝕，還會影響電氣電路的正常工作，潮濕空氣還利于細菌、霉菌的生長。